Sesuai dengan kedudukannya, tugas pokok SPI adalah melaksanakan pengawasan, pengendalian dan audit di bidang keuangan dan kinerja institusi. Dalam melaksanakan tugasnya SPI IAIN Bukittinggi menjalankan fungsi sebagai berikut :
1. Penyusunan Program dan kegiatan pengawasankeuangan dan kinerja institusi
2. Pelaknsanaan pengawasan dan penilaian bidang keuangan dan kinerja institusi
3. Penyusunan perencanaan dan pelaksanaan pemeriksaan dengan tujuan tertentu.
4. Penyusunan dan penyampaian laporan hasil pengawasan internal.
5. Pelaksnaan fungsi lain yang diberikan oleh pimpinan PTKN